A speciális szűrőanyagok a víz konkrét problémáinak célzott megoldására szolgálnak, ha felesleges kompromisszumok nélkül szeretné kézben tartani a paramétereket. A tengeri akvarisztikában főként a foszfát- és szilikátszint csökkentésére, az ammónia eltávolítására vagy olyan különleges helyzetekben a víz utótisztítására használják őket, amikor a szokásos szűrés nem elegendő. Választáskor elsősorban arra érdemes figyelni, milyen problémát szeretne megoldani, mekkora akváriumtérfogatra készült a szűrőanyag, és milyen átfolyást ajánl a gyártó. Fontos a szűrőben vagy reaktorban való helyes elhelyezés és a kimerülés szerinti rendszeres csere is, hogy a hatás stabil és hosszú távon megbízható legyen.