A speciális szűrőanyagok célzottan az adott vízszennyezési problémák megoldására szolgálnak, amikor kompromisszumok nélkül szeretné kézben tartani a paramétereket. A tengeri akvarisztikában elsősorban a foszfátok és szilikátok csökkentésére, az ammónia eltávolítására, vagy speciális helyzetekben a víz további tisztítására használják, amikor a szokásos szűrés nem elegendő. A választásnál érdemes elsősorban arra összpontosítani, hogy milyen problémát szeretne megoldani, milyen akvárium térfogatra van tervezve az anyag, és a gyártó milyen áramlási sebességet javasol. Fontos a szűrőbe vagy reaktorba való megfelelő elhelyezés, valamint a rendszeres csere a kimerülés alapján, hogy a hatás stabil és hosszú távon megbízható legyen.